É claro que você está livre para montar o seu próprio jeito, mas vou contar como eu costumo fazer.
1 - Escanear a capa sozinha e cada uma das demais folhas de duas em duas folhas, criando um arquivo .JPEG para cada imagem.
2 - Numerar os arquivos das folhas usando o nºs (se for folha duplas, use ada esquerda), estabelecendo uma sequência númerica boa, de acordo com o livro, para facilitar o item 5..
3 - Acertar a capa e contracapa para uma folha (dupla se for o caso), do tamanho das outras.
4 - Abrir um arquivo Word com folha (horizontal se for para foljhas duplas) e uma página com margem de um cm.
5 - Inserir todas as imagens, como os arquivos estão em ordem, clique no primeiro e no último e insira tudo. o Word vai abrindo novas páginas automáticamente.
6 - Salvar um .DOC para guardar se tiver que alterar alguma das imagens.
7 - Salvar outro arquivo cono .PDF usando a opção de tamanho mínimo.